C'est justement en montagne que le traitement des eaux usées rejetés par les refuges et les cabanes est le plus difficile, du fait de l’altitude, du froid et de la faible épaisseur des sols. Les résidus des traitements doivent également être épandus sur place, avec un impact potentiel sur l’environnement, ou évacué par héliportage (coût important).

Le Parc national des Pyrénées propose donc d'utiliser des toilettes sèches et de mettre en place des modes d'assainissement écologiques.